BovEpiSign

Il repose sur un dispositif expérimental original de 12 vaches Holstein, permettant de limiter la variabilité génétique, 8 d’entre elles étant des clones, mais aussi la variabilité environnementale en les élevant ensemble dans les mêmes conditions. Le but recherché est d’identifier les signatures épigénétiques cellules-spécifiques afin d’en sélectionner les plus discriminantes. Depuis le démarrage du programme, plus de 63 500 signatures épigénétiques ont pu

être identifiées pour trois populations majeures de cellules de l’immunité : les neutrophiles (3 874 signatures), les monocytes (3 899 signatures) et les lymphocytes (45 439 signatures). Parmi ces signatures les 100 plus explicatives ont été identifiées et font l’objet d’une approche dite d’inférence développée par une équipe de bio-statisticiens, qui permettra de déterminer la proportion des trois types de cellules dans un échantillon de sang ou de lait. Sur les 1,3 millions de positions génomiques mises en évidence, 20 sont suffisantes pour décrire les trois premiers types cellulaires analysés.

Dans un deuxième temps, cette démarche sera mise en place en utilisant des vaches dont le statut clinique et l’origine génétique seront variés afin de vérifier que ces signatures permettent de caractériser ces types cellulaires dans un échantillon de sang ou de lait en conditions « terrain ».