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appel à projets

Apporter des réponses aux enjeux environnementaux liés à l’élevage des ruminants.

Penser l’élevage de demain, c’est vouloir des animaux plus durables, capables de s’adapter à des environnements en évolution tout en exprimant leurs performances de manière optimale. L’objectif de cet axe thématique est d’aborder de façon conjointe les caractéristiques de l’animal et celles de son environnement d’élevage, en considérant la diversité de systèmes de production.
Les efforts de recherches soutenus par APIS-GENE ont vocation à répondre aux enjeux auxquels l’élevage fait face : la compétition pour les ressources alimentaires et les terres (feed/food), le changement climatique et la réduction des gaz à effet de serre. L’amélioration de la robustesse des animaux au travers de caractères comme la résilience, la longévité ou la précocité fait aussi partie des objectifs de cet axe.
L’un des objectifs est également de développer des approches innovantes de phénotypage et de calcul. Ces technologies et méthodes permettent d’étudier des caractères toujours plus complexes, adaptés à la diversité des systèmes d’élevage, dans un souci d’allier progrès génétique et maintien de la diversité. Dans ce contexte, l’épigénétique est un domaine prometteur de solutions.

L’amélioration de la santé et du bien-être animal relèvent et participent au concept « one health, one welfare ». Les maladies, qu’elles soient physiologiques, métabolique, parasitaires ou infectieuses sont des entraves au bien-être animal. Elles pénalisent l’efficacité globale des élevages en induisant des coûts liés à des baisses de productivité, à des augmentations de taux de réforme, de frais vétérinaires. Elles peuvent aussi avoir des conséquences économiques fortes dues à des fermetures de marchés internationaux. APIS-GENE oriente ses financements aussi bien sur des affections spécifiques notamment pour identifier des solutions alternatives aux anthelminthiques (e.g. la résistance aux parasites intestinaux, à la sarcosporidiose ou aux mammites et à la santé des pieds) qu’à l’état général de l’animal (e.g. robustesse, résilience, affections diarrhéiques et respiratoires des veaux).
Définit par l’OIE (organisation mondiale de la santé animale) comme « l’état physique et mental d’un animal en relation avec les conditions dans lesquelles il vit », le bien-être animal a pris une importance croissante dans la société. Jusqu’à peu cette priorité était approchée indirectement par l’amélioration de la santé. Les évolutions technologiques ont permis de débuter des programmes spécifiques à valence génétique.

L’amélioration de la productivité numérique et la réduction des pertes, notamment dues à la mortalité des jeunes, sont enjeux forts de l’élevage des ruminants. Ils permettent une réduction des coûts induits, tels que les frais vétérinaires ou l’équarrissage. La maîtrise de la reproduction est de manière générale un facteur clef de la durabilité des élevages. La garantie de la fertilité, l’amélioration de la résilience reproductive des animaux ou la réduction des périodes improductives sont des caractères clefs pour les élevages.
Des travaux de recherche « à large spectre » sont donc soutenus par APIS-GENE concernant l’optimisation et l’amélioration des technologies de la reproduction ou l’amélioration de l’insémination animale. La qualité de la semence à la fois en bovins et en petits ruminants, l’amélioration du transfert d’embryon qui permet de valoriser, en plus des mâles, les meilleures femelles des élevages et donc d’améliorer le niveau génétique, sont également des thématiques centrales de cet axe.
Parmi les autres sujets au cœur du programme EGER 4.0, l’identification d’alternatives aux hormones est un fort enjeu pour les filières d’élevage, notamment pour les filières petits ruminants.

Les produits issus de l’élevage doivent allier qualité compositionnelle, organoleptique et nutritionnelle afin de répondre aux besoins des consommateurs. Ils doivent aussi répondre aux attentes en termes de qualité technologique et sanitaire afin de satisfaire les besoins de procédés de transformation. Afin d’éviter des pertes économiques et dans le but de diminuer le gaspillage alimentaire, assurer la qualité des produits est un enjeu important pour les filières et l’efficacité globale du système.

Les recherches soutenues par APIS-GENE ont pour ambition d’apporter des réponses pour une amélioration des qualités des produits, notamment en vue de la transformation de ces produits pour la consommation humaine. Elles sont orientées autour de l’identification d’objectifs de sélection pertinents, de QTL et de variants génétiques en lien avec des caractères d’intérêt. C’est par exemple le cas du potentiel de qualité de viande, de la précocité de développement, de la fromageabilité. D’autres sujets de recherches portent sur la résistance des animaux au portage d’agents pathogènes pour l’Homme ou d’agents responsable d’altération de la qualité des produits.

Depuis 2019, APIS-GENE mène le 4e cycle de son programme de recherche finalisée en génomique, baptisé EGER 4.0. Ce programme de recherche a pour ambition d’améliorer l’Efficacité Globale de l’Élevage des Ruminants et apporte une réponse concrète à deux des enjeux majeurs que porte la loi d’avenir pour l’agriculture : produire autrement en protégeant l’environnement.

Axes de recherche

APIS-GENE soutient la recherche en génomique animale des ruminants tout au long du processus de l’innovation. Ce processus concerne d’abord des programmes d’amorçage, qui visent à faire émerger de nouvelles thématiques de recherche. Les programmes de thèse ou des programmes de recherche, fondamentale ou appliqué, sont au cœur du processus d’innovation. APIS-GENE soutient aussi des programmes de finalisation afin d’assurer le transfert technologique des innovations jusque dans les élevages.


Chercheurs, responsables de laboratoire, start-up, APIS-GENE est à votre écoute et peut vous accompagner dans vos projets de recherche. Chaque année, APIS-GENE ouvre un nouvel appel à projets.


Chaque projet est évalué sur son excellence scientifique par un Comité Scientifique Opérationnel avant d’être labellisé, s’il répond aux enjeux des filières actionnaires d’APIS-GENE.

Types de programmes

amorçage

Faire émerger de nouvelles thématiques de recherche

APIS-GENE soutient l’innovation pour amorcer des problématiques complexes, investiguer de nouvelles questions, évaluer la faisabilité scientifique et technique, apporter une preuve de concept et lever des verrous scientifiques.

durée

max 2 ans

financement

max 125 000 € HT

thèses

Former aujourd’hui les chercheurs de demain

Former les chercheurs est un enjeu majeur pour lequel APIS-GENE a contribué dans le domaine des filières animales (cofinancement de thèses, ANRT, Régions et Départements d’Instituts de recherche).

durée

max 3 ans

COfinancement

max 64 000 € HT

Programme de R&D

Financer l’innovation et la R&D

APIS-GENE investit dans la recherche par le financement de programmes de R&D, en propre, ou en cofinancement de programmes labellisés par l’ANR par exemple.

durée

4 ans

financement

670 000 € HT

Programme de finalisation

assurer l’avant-vente et le déploiement terrain

APIS-GENE met en œuvre les résultats de la recherche sur le terrain. Ces programmes permettent aux équipes de recherche ayant préalablement produit un résultat innovant de réaliser une phase d’avant-vente.

durée

max 2 ans

financement

max 330 000 € HT

Développement technologique

Mettre en place de nouvelles offres

APIS-GENE soutient le développement technologique qui, en parallèle des avancées scientifiques spécifiques de ses axes stratégiques, permet de mettre en place de nouvelles offres sur le terrain. Ces programmes n’ont pas a être cantonnés strictement aux outils « omiques » ni même être en lien direct avec les priorités d’EGER 4.0 et peuvent de ce fait couvrir des domaines transverses comme le numérique ou l’Intelligence Artificielle.

durée

max 2 ans

financement

330 000 € HT

L’ensemble des axes stratégiques du programme scientifique EGER 4.0 est éligible.

Les porteurs de programmes de thèses sont invités à signaler tout cofinancement acquis ou en cours de demande avant le dépôt du programme à APIS-GENE ou pendant le processus d’évaluation.

Toutes les entités de recherche publiques et privées agréées au Crédit Impôt Recherche sont éligibles.

Critères d'éligibilité

Processus décisionnels

Projets de recherche

Les projets soumis à l'Appel A Projets 2025 sont expertisés en 2 phases par les Comités Scientifique Opérationnel et Stratégique d’APIS-GENE
  • 1ère phase : sélection des projets sur leur excellence scientifique, les collaborations et valorisations potentielles décrites dans la Manifestation d’Intention,
  • 2nde phase : pour les projets retenus en phase 1, apport de compléments et détails pour répondre aux critiques et/ou suggestions d’APIS-GENE.
  • Une décision finale sera rendue courant juin 2025.

La contractualisation des projets retenus se fera dans la continuité du processus décisionnel d'APIS-GENE pour un démarrage du programme possible dès septembre 2025.

Thèses

  • Les thèses proposées au travers d’une Manifestation d’Intention seront évaluées par les Comités Scientifique Opérationnel et Stratégique d’APIS-GENE
  • Une décision finale sur le cofinancement sera rendue courant juin 2025.

La contractualisation des projets retenus se fera, sous réserve de l'obtention d'un cofinancement, dans la continuité du processus décisionnel d'APIS-GENE. Le démarrage du programme sera possible dès septembre 2025 et au plus tard en janvier 2026.

Appel à projet 2025 - calendrier

Programmes de recherche

4 nov. 2024

Ouverture de l'appel à projets

14 fév. 2025

Clôture de soumission des MI

31 mars 2025

Publication des résultats

14 avr. 2025
Ouverture de la phase de soumission des dossiers détaillés
9 mai 2025

Clôture de soumission des dossiers détaillés

Juin 2025

Publication des résultats

Sept. 2025

Contractualisation des projets sélectionnés

Programmes de thèses

4 nov. 2024

Ouverture de l'appel à projets

9 mai 2025

Clôture de soumission des MI

Juin 2025

Publication des résultats.

Sept. 2025

Contractualisation des projets sélectionnés.

Documents supports de l'AAP 2025